肺魚基因組的研究面臨著諸多挑戰(zhàn)，主要包括樣本的獲取難度、高異質(zhì)性導(dǎo)致的基因表達(dá)差異以及復(fù)雜環(huán)境對研究的影響等。肺魚的基因組相對較小，這使得對其基因組的解析和功能研究更為困難。隨著科技的進(jìn)步和研究方法的改進(jìn)，這些問題正逐步得到解決。

肺魚基因組研究的挑戰(zhàn)

肺魚基因組研究面臨的主要挑戰(zhàn)包括數(shù)據(jù)量巨大、成本高昂以及技術(shù)突破的需求。

數(shù)據(jù)量巨大

肺魚基因組的規(guī)模極其龐大，例如南美洲肺魚的DNA超過900億個(gè)堿基，是已知最大的動(dòng)物基因組。這樣的數(shù)據(jù)量對數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、管理和分析都是巨大的挑戰(zhàn)。以肺魚的基因組來說，其超過900億個(gè)堿基的數(shù)據(jù)量在存儲(chǔ)上就需要大量的存儲(chǔ)空間，而且在分析這些數(shù)據(jù)的過程中，對于硬件設(shè)備（如服務(wù)器、硬盤等）和軟件算法提出了很高的要求。

成本高昂

進(jìn)行肺魚基因組測序需要大量的人力、物力投入，昂貴的測序設(shè)備、試劑等都會(huì)導(dǎo)致成本居高不下。例如，英國生物銀行進(jìn)行的50萬名參與者的全基因組測序，經(jīng)歷5年花費(fèi)超2億英鎊。

技術(shù)突破的需求

為了應(yīng)對上述挑戰(zhàn)，需要技術(shù)上的突破。例如，高通量測序儀的發(fā)展，如華大智造發(fā)布的DNBSEQ-T20×2測序儀，配備了開放式的并行處理系統(tǒng)，可以在短時(shí)間內(nèi)將測序生產(chǎn)規(guī)模提升至新的量級，同時(shí)支持6張超大尺寸的測序載片上機(jī)運(yùn)行，每張測序載片既能獨(dú)立運(yùn)行不同的測序讀長和測序應(yīng)用，還能夠支持混合測序，最大程度提高測序效率和測序規(guī)模。一臺(tái)DNBSEQ-T20×2單次運(yùn)行通量達(dá)42Tb（PE100）或72Tb（PE150），是常規(guī)超高通量測序儀的4.5倍至7倍，這有助于應(yīng)對大型基因組測序中數(shù)據(jù)量大和成本高的問題。

總結(jié)

總的來說，肺魚基因組研究的挑戰(zhàn)主要集中在如何處理和分析龐大的數(shù)據(jù)量、控制高昂的成本以及實(shí)現(xiàn)技術(shù)上的創(chuàng)新以提高測序效率和降低成本。

肺魚基因組測序技術(shù)最新進(jìn)展

肺魚基因組數(shù)據(jù)分析新方法

肺魚基因組研究的國際合作案例

肺魚基因組研究對進(jìn)化生物學(xué)的影響